2017年4月北京大学谢晓亮教授团队在Science上发表“Single-Cell Whole Genome Analyses by Linear Amplification via Transposon Insertion (LIANTI) (doi: 10.1126/science.aak9787)”文章,开发一种新型的单细胞全基因组线性扩增的方法—LIANTI(Linear Amplification with Transposon Insertion)用于单细胞全基因组测序。
LIANTI法通过转座子插入进行线性放大。基因组被含有T7启动子的Tn5转座子随机片段化 ,T7启动子允许线性扩增。LIANTI法测量拷贝数的空间分辨率提高了3个数量级(能在千碱基分辨率进行微小CNV检测,基因组覆盖率可达到97%),能直接观察从细胞到细胞不同的随机发生的DNA复制起始位点。他们用新方法检测了被紫外线照射过的单个人类细胞的单核苷酸突变,结果明显优于目前已知的其他方法。这意味LIANTI能更有效、精准地检测出更多疾病突变。
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