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大规模单细胞测序时代开启
行业新闻 2018-11-15 14:38

近期,Nature Methods发表了数篇关于大规模单细胞测序仪相关文章,包括文库制备、测序方法、分析方法等,这里介绍其中的几篇。


第一篇:Scalable whole-genome single-cell library preparation without preamplification

文章介绍了直接文库准备(DLP)方法,一种稳定、可扩展、高保真的方法。用纳升体积的转位反应制备单细胞全基因组文库,不需要预扩增。文章检测了782个细胞,结果表明,与现有方法相比,低深度测序显示出更大的均一覆盖度和更可靠的拷贝数变化。


单细胞测序仪_大规模单细胞测序时代开启
 

第二篇:Effective detection of variation in single-cell transcriptomes using MATQ-seq

文章报道了一种高灵敏度的
单细胞测序仪总RNA定量测序方法,即利用多重退火和基于dC尾定量的单细胞RNA测序方法(MATQ-seq)。文章用该方法获得了单细胞测序仪全转录组之间真正的生物学变异。


第三篇:Sequencing thousands of single-cell genomes with combinatorial indexing

文章提出了
单细胞测序仪胞组合标引测序方法(SCI-seq),同时产生成千上万个单细胞文库,检测体细胞拷贝数变异。文章构建了16698个单细胞文库,包括培养细胞系、灵长类前额皮质组织和两个人类腺癌组织,并详细分析了胰腺肿瘤亚克隆变异。

单细胞测序仪_大规模单细胞测序时代开启


第四篇:Single-cell mRNA quantification and differential analysis with Census

本文作者将人口普查算法引入RNA-seq数据分析,将相对RNA-seq表达水平转换为相对转录量,而不需要加标对照。该方法能显著提高精确度。


第五篇:Massively multiplex single-cell Hi-C

该篇文章针对染色体高级结构,提出了基于多重标引的
单细胞测序仪Hi-C技术。