新闻中心
行业新闻
基于RNA-seq谱分析拟南芥发育转录组的高分辨率图
行业新闻 2018-12-21 13:40

  拟南芥(Arabidopsis thaliana)是植物分子生物学,遗传学和基因组学的长期建立的模式物种,并且拟南芥基因功能的研究为制定假设和设计涉及其他植物(包括经济上重要的物种)的实验提供了基础。因此,全面了解拟南芥基因组以及对其相关基因表达的详细和准确理解对于基础研究和实际应用都非常重要。这一目标依赖于新的遗传和基因组资源的开发,涉及新的数据采集和分析方法。

基于RNA-seq谱分析拟南芥发育转录组的高分辨率图谱

  来自俄罗斯科学院的研究人员使用高通量转录组测序在这里展示了不同器官和发育阶段的A.thaliana基因表达谱的全基因组分析。在79个器官和发育阶段评估了25,706个蛋白质编码基因的表达,以及它们的稳定性和它们的时空特异性。寻找可变剪接事件确定了37,873个先前未报告的剪接点,其中约30%发生在基因间区域。这些可能代表TAIR10数据库中未包含的新型剪接基因。

  可用性 - 这些数据存放在基于网络的开放式数据库中,TraVA,可以显示和分析基因表达谱和器官与发育阶段之间的差异基因表达。